The tärkein ero motiivin ja domeenin välillä proteiinirakenteessa on se motiivi on supersekundaarinen rakenne, kun taas proteiinidomeeni on proteiinien tertiäärinen rakenne. Lisäksi motiivit suorittavat samanlaisia ​​biologisia toimintoja tietyn proteiiniperheen kautta, kun taas proteiinidomeeni kehittyy, toimii ja on olemassa muusta proteiiniketjusta riippumatta.

Motiivi ja alue kuuluvat rakenteellisiin komponentteihin, joita voi esiintyä proteiiniketjussa. Lisäksi niillä on rakenteellinen ja toiminnallinen merkitys proteiineissa.

Proteiinialue, proteiinimotiivi, proteiinirakenne, toissijainen rakenne, tertiäärinen rakenne

Mikä on motiivi proteiinirakenteessa

Motiivi on proteiinin supersekundaarinen rakenne. Yleensä proteiinin ensimmäinen kehittyvä 3D-rakenne on toissijainen rakenne, joka voi olla joko alfa-helix tai beeta-arkki. Myös tämä toissijainen rakenne muodostetaan neutraloimaan eri aminohappojen luonnollinen napaisuus ensisijaisessa proteiinirakenteessa, joka on aminohapposekvenssi. Tyypillisesti tämä neutralointi tapahtuu muodostamalla vetysidoksia. Lisäksi nämä toissijaiset rakenteet yhdistyvät keskenään muodostaen nämä motiivit. Yhdistäminen tapahtuu pienten silmukoiden kautta.

Kuva 1: Sinkkikuitumotiivi

Lisäksi joskus tietyn proteiiniperheen motiivit suorittavat samanlaisen tehtävän. Esimerkiksi sinkkikuitumotiivi suorittaa DNA -sitoutumistoiminnon. Jotkut muut esimerkit motiiveista proteiinirakenteessa ovat beeta-hiusneula-aihe, kreikkalainen avainmotiivi, Omega-silmukka-motiivi, helix-loop-helix-motiivi, helix-turn-helix-motiivi, pesämotiivi, kapeakuvio jne.

Mikä on domeeni proteiinirakenteessa

Domeeni proteiinirakenteessa on proteiinin tertiäärinen rakenne. Lisäksi se muodostuu, on olemassa ja toimii proteiinin muista komponenteista riippumatta. Vaikka motiivi muodostuu proteiinin toissijaisten rakenne -elementtien vuorovaikutuksen kautta, toissijaisten rakenne -elementtien väliset vuorovaikutukset ovat vahvempia domeenissa. Näiden toissijaisten rakenne -elementtien väliin voi muodostua monenlaisia ​​sidoksia. Siitä muodostuvien sidosten päätyyppi on disulfidisillat. Ne ovat myös vakaimpia vuorovaikutuksia.

Kuva 2: Pyruvaatikinaasin kolme domeenia

Samankaltaisuudet motiivin ja alueen välillä proteiinirakenteessa

Ero motiivin ja alueen välillä proteiinirakenteessa

Määritelmä

Proteiinirakenteen motiivi viittaa ketjun kaltaiseen biologiseen rakenteeseen, joka koostuu toissijaisten rakenne-elementtien välisestä yhteydestä, kun taas proteiinirakenteen domeeni viittaa kolmiulotteisen proteiinirakenteen itsenäiseen taittoyksikköön. Näin ollen tämä on tärkein ero motiivin ja verkkotunnuksen välillä.

Rakenteen tyyppi

Toinen ero motiivin ja domeenin välillä on, että motiivi on proteiinin supersekundaarinen rakenne, kun taas domeeni on proteiinin tertiäärinen rakenne.

Muodostus

Merkitys

Motiiveilla on pääasiassa rakenteellinen tehtävä proteiinirakenteessa, kun taas domeeneilla on pääasiassa toiminnallinen merkitys.

Toiminto

Lisäksi motiiveilla on samanlaiset toiminnot proteiiniperheiden kautta, kun taas domeeneilla on ainutlaatuisia toimintoja.

Vakaus

Lisäksi motiivit eivät ole stabiileja itsenäisesti, kun taas domeenit ovat itsenäisesti stabiileja. Siksi tämä on myös tärkeä ero motiivin ja toimialueen välillä.

Johtopäätös

Motiivi proteiinirakenteessa on proteiinin supersekundaarinen rakenne. Yhdistettävyys alfa-heeliksien ja beeta-arkkien välillä tuottaa motiiveja. Lisäksi niillä on samanlaisia ​​toimintoja tietyssä proteiiniperheessä. Toisaalta domeeni on proteiinin tertiäärinen rakenne. Merkittävästi se voi muodostua ja esiintyä itsenäisesti proteiinirakenteessa. Lisäksi sillä on ainutlaatuinen tehtävä proteiinirakenteessa. Siksi tärkein ero aiheen ja alueen välillä on rakenne ja tärkeys.

Viitteet:

1. "Proteiini 3D -rakenne: rakenteelliset tasot, motiivit ja taitokset." Proteiinin kolmiulotteisen rakenteen perusperiaatteet: Proteiinirakenteen, motiivien, verkkotunnusten ja tietokantojen tasot, saatavana täältä.

Kuva:

1. ”Sinkkisormi”, Thomas Splettstoesser (www.scistyle.com)-itse tehty, ATE-rakenteen 1A1L perusteella, avoimen lähdekoodin molekyylivisualisointityökalu PyMol ja Cinema 4D (CC BY-SA 4.0) Commons Wikimedia 2: n kautta. "Pyruvaatikinaasiproteiinidomeenit", Thomas Splettstoesser (www.scistyle.com)-Oma työ (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedian kautta