Tärkein ero - DNA -polymeraasi 1 vs 3

DNA -polymeraasi 1 ja 3 ovat kahdenlaisia ​​DNA -polymeraaseja, jotka osallistuvat prokaryoottiseen DNA: n replikaatioon. DNA -polymeraasit auttavat uuden DNA -juosteen synteesiä kokoamalla nukleotidit emojuosteeseen. Sekä DNA -polymeraasilla 1 että 3 on replikatiivinen aktiivisuus 5 ' - 3' -suunnassa. DNA -polymeraasilla 1 on sekä 5 ” - 3” että 3 ” - 5” eksonukleaasiaktiivisuus. DNA -polymeraasi 3: lla on kuitenkin vain 3 ' - 5' eksonukleaasiaktiivisuus. The tärkein ero DNA -polymeraasin 1 ja 3 välillä on se DNA -polymeraasi 1 osallistuu alukkeiden poistamiseen fragmenteista ja korvaa aukon asiaankuuluvilla nukleotideillä, kun taas DNA -polymeraasi 3 osallistuu pääasiassa johtavien ja jäljessä olevien juosteiden synteesiin.

Keskeiset alueet

1. Mikä on DNA -polymeraasi 1 - Määritelmä, rakenne, toiminto 2. Mikä on DNA -polymeraasi 3 - Määritelmä, rakenne, toiminto 3. Mitkä ovat samankaltaisuudet DNA -polymeraasin 1 ja 3 välillä? - Yleiskatsaus 4. Mikä on ero DNA -polymeraasin 1 ja 3 välillä? - Keskeisten erojen vertailu

Keskeiset termit: DNA -polymeraasi 1, DNA -polymeraasi 3, 3-5 tuuman eksonukleaasiaktiivisuus, 5--3 tuuman eksonukleaasiaktiivisuus, aukkojen täyttö, Klenow -fragmentti, polymerointi, oikoluku, prokaryoottinen DNA -replikointi

Mikä on DNA -polymeraasi 1

DNA -polymeraasi 1 on eräänlainen DNA -polymeraasi, jolla on polymerointiaktiivisuus, oikoluku ja alukkeen poistoaktiivisuus. DNA -polymeraasi 1 löysi ensimmäisen kerran Arthur Kornberg vuonna 1956. Hänelle myönnettiin Nobelin palkinto tästä löydöstä vuonna 1959. DNA -polymeraasi 1 on polA -geenin koodaama. PolA -geenin koko on 3000 bp. DNA -polymeraasi 1 on mukana prokaryoottisessa DNA: n replikaatiossa, koska se auttaa uuden DNA -juosteen synteesiä 5 ' - 3' suunnassa. Lisäksi DNA -polymeraasi 1 osallistuu aukkojen täyttämiseen, korjaamiseen ja rekombinaatioon. Entsyymi, DNA-polymeraasi 1, täyttää kaksijuosteisen DNA: n aukot, mikä on tärkeää DNA: n korjaamisessa. DNA -polymeraasilla 1 on sekä 3 ” - 5” eksonukleaasiaktiivisuus että 5 ” - 3” eksonukleaasiaktiivisuus. 5 '- 3' eksonukleaasiaktiivisuus hajottaa sekä yksijuosteisen että kaksijuosteisen DNA: n 5 '- 3' suuntaan. Kun 5' -3' -eksonukleaasiaktiivisuus on poistettu DNA -polymeraasi 1 -holoentsyymistä, jäljelle jäänyttä molekyyliä kutsutaan Klenowin fragmentti.

Kuva 1: DNA -polymeraasin 1 toiminnalliset alueet

Klenow -fragmentti on hyödyllinen molekyyli DNA -monistusreaktioissa. Tämä on tärkeää virheen korjaus. DNA -polymeraasi 1: n kolme toiminnallista aluetta on esitetty kuvassa 1.

Mikä on DNA -polymeraasi 3

DNA -polymeraasi 3 on tärkein entsyymi, joka osallistuu prokaryoottiseen DNA: n replikaatioon. DNA -polymeraasilla 3 on 5 ' - 3' -polymerointiaktiivisuus, jossa uusia nukleotideja lisätään kasvavaan ketjuun sen 3' -päässä. Entsyymi auttaa saapuvien nukleotidien emäsparia templaattiketjun kanssa. DNA -polymeraasi 3: n toinen tehtävä on replikoidun DNA: n oikoluku. DNA -polymeraasilla 3 on 3 ' - 5' eksonukleaasiaktiivisuus. Näin ollen tämä entsyymi lukee juuri lisätyt nukleotidit, ja jos templaattiketjussa on ristiriita, se poistetaan ja syntetisoidaan uudelleen. Siksi DNA -polymeraasi 3 on tärkeä genomin vakauden ylläpitämisessä.

Kuva 2: DNA -polymeraasi 3

DNA -polymeraasi 3 -holoentsyymit koostuvat kymmenestä alayksiköstä, jotka on järjestetty kahteen DNA -polymeraasiin. Α -alayksikkö on katalyyttinen alayksikkö. Ε -alayksiköllä on 3-5 'oikoluku. Un -alayksiköllä on tuntematon toiminto. A -alayksikkö on dnaE -geenin koodaama. Ε- ja θ -alayksiköt koodaavat dnaQ- ja holE -geenit. DNA -polymeraasin 3 rakenne on esitetty kuviossa 2.

DNA -polymeraasin 1 ja 3 samankaltaisuudet

Ero DNA -polymeraasin 1 ja 3 välillä

Määritelmä

DNA -polymeraasi 1: DNA -polymeraasi 1 on polA -geenin koodaama DNA -polymeraasi, joka on mukana prokaryoottisessa DNA: n replikaatiossa.

DNA -polymeraasi 3: DNA -polymeraasi 3 on tärkein entsyymi, joka auttaa prokaryoottisen DNA: n replikaatiota.

Löytö

DNA -polymeraasi 1: DNA -polymeraasi 1 löysi ensimmäisen kerran Arthur Kornberg vuonna 1956.

DNA -polymeraasi 3: DNA -polymeraasi 3: n löysivät ensimmäisen kerran Thomas Kornberg ja Malcolm Gefer vuonna 1970.

Koodannut

DNA -polymeraasi 1: DNA -polymeraasi 1 on polyA -geenin koodaama.

DNA -polymeraasi 3: DNA -polymeraasi 3: ta koodaavat dnaE-, dnaQ- ja holE -geenit.

Perhe

DNA -polymeraasi 1: DNA -polymeraasi 1 kuuluu DNA -polymeraasiperheeseen A.

DNA -polymeraasi 3: DNA -polymeraasi 3 kuuluu DNA -polymeraasiperheeseen C.

Eksonukleaasiaktiivisuus

DNA -polymeraasi 1: DNA -polymeraasilla 1 on sekä 3 ” - 5” eksonukleaasiaktiivisuus että 5 ” - 3” eksonukleaasiaktiivisuus.

DNA -polymeraasi 3: DNA -polymeraasi 3: lla on vain 3-5 tuuman eksonukleaasiaktiivisuus.

Toiminto

DNA -polymeraasi 1: DNA -polymeraasi 1 poistaa RNA -alukkeen 5 ' - 3' suunnasta.

DNA -polymeraasi 3: DNA -polymeraasi 3 lisää deoksiribonukleiinihappoja 3 -päähän.

RNA -aluke

DNA -polymeraasi 1: DNA -polymeraasi 1 poistaa RNA -alukkeen.

DNA -polymeraasi 3: DNA -polymeraasi 3 vaatii RNA -alukkeen DNA: n syntetisoimiseksi.

DNA -synteesi

DNA -polymeraasi 1: DNA -polymeraasi 1 lisää nukleotideja kasvavaan polynukleotidiketjuun.

DNA -polymeraasi 3: DNA -polymeraasi 3 on avainentsyymi DNA: n syntetisoimiseksi prokaryooteissa.

Myöhässä/johtavia aloja

DNA -polymeraasi 1: DNA -polymeraasi 1 vaikuttaa vain jäljessä olevaan juosteeseen.

DNA -polymeraasi 3: DNA -polymeraasi 3 vaikuttaa sekä replikaatiohaarukan johtaviin että jäljessä oleviin juosteisiin.

DNA -synteesin nopeus

DNA -polymeraasi 1: DNA -polymeraasi 1 voi lisätä 10-20 nukleotidia sekunnissa.

DNA -polymeraasi 3: DNA -polymeraasi 3 voi lisätä noin 1000 nukleotidia sekunnissa.

Johtopäätös

DNA -polymeraasi 1 ja 3 ovat kahdenlaisia ​​DNA -polymeraaseja, jotka osallistuvat prokaryoottiseen DNA: n replikaatioon. Molemmilla DNA -polymeraasityypeillä on 5 ' - 3': n polymerointiaktiivisuus. Lisäksi molemmilla entsyymeillä on 3 ' - 5' eksonukleaasiaktiivisuutta oikolukua varten. DNA -polymeraasi 3: n päätehtävä on sen tehtävä polymeroinnissa. DNA -polymeraasilla 1 on kuitenkin 5’ - 3’ eksonukleaasiaktiivisuutta. DNA -polymeraasi 1 kykenee poistamaan alukkeen 5 ' - 3' eksonukleaasiaktiivisuudella. Muodostusrako täytetään myös DNA -polymeraasilla 1. Siksi suurin ero DNA -polymeraasin 1 ja 3 välillä on niiden roolit prokaryoottisen DNA: n replikaatiossa.

Viite:

1. "DNA -polymeraasi I." Worthingtonin entsyymikäsikirja. N.p., n.d. Web. Saatavana täältä. 9. elokuuta 2017. 2. Marians, Kenneth J., Hiroshi Hiasa ja Deok Ryong Kim. "Ydin -DNA -polymeraasi III -yksiköiden rooli replikaatiohaarukassa α on ainoa prosessi, jota tarvitaan prosessoivaan toistoon." Biologisen kemian lehti. N.p., 23. tammikuuta 1998. Web. Saatavana täältä. 9. elokuuta 2017.

Kuva:

1. ”PolymeraseDomains” Tekijä (tuntematon) “Kuukauden molekyyli”, maaliskuu 2000 - Protein Data Bank (Public Domain) Commons Wikimedia2: n kautta. "DNA-polymeraasi III (alayksiköillä)" Alepopoli-Oma työ (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedian kautta