The tärkein ero CRISPR: n ja Cas9: n välillä on se CRISPR on osa bakteerien puolustusjärjestelmää, joka koostuu lyhyistä palindromisista sekvensseistä, kun taas Cas9 on CRISPR -järjestelmän tuottama endonukleaasi, joka toimii molekyylisaksina. CRISPR tarkoittaa Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats, kun taas Cas tarkoittaa CRISPR: ään liittyvää proteiinia 9. Lyhyet palindromiset toistot tuottavat CRISPR RNA (crRNA), joka on spesifinen kohdesekvenssille. Cas9 leikkaa crRNA: n määrittämän DNA -sekvenssin.

CRISPR ja Cas9 ovat CRISPR/Cas9 -järjestelmän kaksi osaa, joka on tärkeä osa bakteerien immuunijärjestelmää ja joka suojaa hyökkääviä viruksia vastaan. Tällä hetkellä CRISPR/Cas9 -järjestelmä on yksi nopeimmista, halvemmista ja tarkemmista genomin muokkaustyökaluista, joilla on laaja valikoima sovelluksia.

Keskeiset alueet

1. Mikä on CRISPR - Määritelmä, rakenne, genomin muokkaus 2. Mikä on Cas9 - Määritelmä, tosiasiat, genomin muokkaus 3. Mitä samankaltaisuuksia CRISPR: n ja Cas9: n välillä on? - Yleiskatsaus 4. Mitä eroa on CRISPR: n ja Cas9: n välillä - Keskeisten erojen vertailu

Keskeisiä termejä

Cas9, CRISPR, CRISPR/Cas9, crRNA, genomin muokkaus

Mikä on CRISPR

CRISPR (Clistattu Resimerkkinä Minävälitön Short Palindrominen Repeats) on toistuvan sekvenssin yksikkö, joka löytyy bakteeri- ja arkeologisista genomeista. Francisco Mojica löysi sen ensimmäisen kerran arkeassa. CRISPR: n toistuvat sekvenssit keskeytetään välilyönneillä. Nämä välikejaksot ovat jäänteitä aiemmista hyökkääjistä. Siksi järjestelmä toimii geneettisenä muistina hyökkäävän bakteriofagin havaitsemiseksi ja tuhoamiseksi. Välisekvenssit transkriboidaan lyhyiksi RNA -sekvensseiksi, joita kutsutaan crRNA: ksi, jotka ohjaavat järjestelmää sitoutumaan spesifisiin kohdesekvensseihin. Kun tällainen sekvenssi on sitoutunut, CRISPR -järjestelmän, kuten Cas9, koodaama endonukleaasi katkaisee määritetyn DNA: n sulkemalla sen.

Kuva 1: CRISPR -järjestelmä

CRISPER/Cas9 on luonnossa esiintyvä bakteerien genomin editointijärjestelmä. Sitä käytetään myös genomin muokkaustyökaluna laboratoriossa. Tutkijat luovat keinotekoisesti pieniä RNA -molekyylejä, joita kutsutaan opas RNA (gRNA), jotka sitoutuvat genomin kohdesekvenssiin. Kun Cas9: n aktiivisuus katkaisee kohde -DNA -sekvenssin, solumekanismit syntetisoivat DNA: n uudelleen. Tai muuten, poistettu DNA -osa voidaan korvata toisella DNA -palalla.

Mikä on Cas9

Cas9 on endonukleaasi, joka leikkaa spesifisen kaksijuosteisen DNA: n. Sen koodaa bakteeri -CRISPR -järjestelmä. Kohde -DNA -sekvenssi määritetään CRISPR -järjestelmän sycrRNA: n avulla. Käsittelemällä kohdesekvenssiä CRISPR -järjestelmää voidaan käyttää manipuloimaan tiettyä DNA -sekvenssiä genomissa. Siksi CRISPR/Cas9 -järjestelmää käytetään geneettisten häiriöiden hoitoon.

Kuva 2: Casin rooli CRISPR -järjestelmässä

Toinen CRISPR -järjestelmän kanssa toimiva endonukleaasityyppi on Cpf1.

CRISPR: n ja Cas9: n samankaltaisuudet

Ero CRISPR: n ja Cas9: n välillä

Määritelmä

CRISPR viittaa bakteereista ja arkeoista löydettyjen DNA-sekvenssien perheeseen, kun taas Cas9 viittaa CRNAPR: ään liittyvään RNA-ohjattuun DNA-endonukleaasiin

Tarkoittaa

CRISPR on ryhmitelty säännöllisesti välissä olevia lyhyitä palindromisia toistoja, kun taas Cas tarkoittaa CRISPR: ään liittyvää proteiinia.

Merkitys

CRISPR on klusteri lyhyitä palindromisia sekvenssejä, kun taas Cas9 on CRISPR: ään koodattu endonukleaasi.

Toiminto

CRISPR tuottaa crRNA: ta, joka sitoutuu spesifisesti kohdesekvenssiin, kun taas Cas9 toimii molekyylisaksena, joka leikkaa crRNA: n määrittämän DNA -sekvenssin.

Johtopäätös

CRISPR on lyhyt palindrominen sekvenssi, joka löytyy bakteerien genomista. Se on tärkeä estäessään tunkeutuvaa bakteriofagia. Cas9 on CRISPR -järjestelmän koodaama endonukleaasi. Se katkaisee crRNA: n määrittämän nukleotidisekvenssin. CrRNA tuotetaan CRISPR -matriisin transkriptiolla. Suurin ero CRISPR: n ja Cas9: n välillä on CRISPR -järjestelmän kunkin komponentin toiminto.

Viite:

1. "Mikä on CRISPR-Cas9?" Faktat, Wellcome Genome Campusin julkinen sitoutumisryhmä, 19. joulukuuta 2016, saatavana täältä

Kuva:

1. “crRNA-Cas9” Marius walter-Oma työ (CC BY-SA 4.0) Commons Wikimedia2: n kautta. ”Crispr” James atmos-Oma työ (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedian kautta