Tärkein ero - cDNA vs. genominen DNA

Komplementti -DNA (cDNA) ja genominen DNA ovat kahdenlaisia ​​DNA -molekyylejä, joita käytetään molekyylibiologian tutkimuskokeissa. Sekä cDNA että genomi -DNA koostuvat DNA -nukleotideista. cDNA tuotetaan käänteiskopioimalla kudoksesta uutettu RNA. Käänteistranskriptioon käytetyt RNA-tyypit voivat olla kokonais-RNA, pre-mRNA, RNA, ribosomaalinen RNA tai tRNA. Genominen DNA voidaan kuitenkin eristää suoraan solusta. The tärkein ero cDNA: n ja genomisen DNA: n välillä on se cDNA edustaa tietyn organismin transkriptiota, kun taas genominen DNA edustaa genomia.

Keskeiset alueet

1. Mikä on cDNA - Määritelmä, tosiasiat, rooli 2. Mikä on genominen DNA - Määritelmä, tosiasiat, rooli 3. Mitkä ovat samankaltaisuudet cDNA: n ja genomisen DNA: n välillä - Yleiskatsaus 4. Mikä on ero cDNA: n ja genomisen DNA: n välillä - Keskeisten erojen vertailu

Keskeiset termit: täydentävä DNA (cDNA), genomi, genominen DNA (gDNA), käänteiskopiointi, RNA, transkriptio

Mikä on cDNA

cDNA (täydentävää DNA: ta) viittaa synteettiseen DNA: han, jonka emäsekvenssit ovat komplementaarisia DNA: lle. Se tuotetaan RNA -templaattien käänteistranskriptiosta. Käänteistä transkriptiota voidaan käyttää kokonais-RNA: ta, pre-mRNA: ta, RNA: ta, ribosomaalista RNA: ta tai tRNA: ta. Käänteistranskriptaasi on entsyymi, joka katalysoi cDNA: n tuottamisreaktion RNA: sta. Käänteistranskriptio yhdistettynä PCR: ään on esitetty kuvassa 1.

Kuva 1: Käänteistranskriptio yhdistettynä PCR: ään

cDNA: ta käytetään pääasiassa eukaryoottisten geenien kloonaamiseen prokaryoottisissa genomeissa. Eksonit koostuvat proteiinien koodaavasta alueesta. Eukaryooteissa intronit keskeyttävät koodausalueen. Transkription aikana sekä intronit että eksonit koodataan pre-mRNA: han. Mutta mRNA -käsittelyn aikana intronit poistetaan mRNA: sta, jolloin syntyy kypsä mRNA silmukoimalla eksonit yhteen. Organismin kokonaista mRNA: ta kutsutaan transkriptomiksi. Kuitenkin prokaryooteilla ei ole mRNA -prosessointimekanismeja. Siten mRNA: ta käytetään syntetisoimaan cDNA, joka sisältää vain genomin proteiinia koodaavia alueita. Tätä cDNA: ta käytetään geenien kloonaamiseen prokaryooteiksi. cDNA tuotetaan luonnollisesti retroviruksissa, kun RNA -genomi muuttuu DNA: ksi.

Mikä on genominen DNA

Genominen DNA (gDNA) viittaa genomin kromosomaalisen DNA: n kokonaisuuteen. Tietyn organismin geenien kokonaisjoukko viitataan sen genomiin. Kuitenkin paitsi genomin geenit ovat aktiivisia. Useimmilla organismiryhmillä on samanlaisia ​​genomisia DNA -ryhmiä. Organismin genomi siirtyy seuraavalta sukupolvelta toiselle. Yleensä genomit koostuvat suuresta määrästä emäspareja. Esimerkiksi ihmisen genomi koostuu noin 3 miljardista emäsparista. Ihmisen genomin kromosomit on esitetty kuvassa 2.

Kuva 2: Ihmisen genomin kromosomit

Genomisesta DNA: sta löytyvät neljä sekvenssityyppiä ovat proteiinia koodaavat geenit, toistuvasti toistuvat geenit, toistuva DNA ja välike-DNA. Genomista DNA: ta käytetään monissa molekyylibiologian kokeissa. Genomisen DNA: n eristäminen on helppoa verrattuna cDNA: n valmistukseen. Genomista DNA: ta voidaan käyttää PCR -templaateina kloonauksessa, sekvensoinnissa, genomikirjastojen valmistelussa, DNA -sormenjälkien ottamisessa, geenirakenteiden tutkimuksessa ja mutaatioiden/poikkeavuuksien havaitsemisessa.

CDNA: n ja genomisen DNA: n samankaltaisuudet

Ero cDNA: n ja genomisen DNA: n välillä

Määritelmä

cDNA: cDNA on synteettinen DNA, jonka emäsekvenssit ovat komplementaarisia genomisen DNA: n kanssa.

Genominen DNA: Genominen DNA on genomin kromosomaalisen DNA: n kokonaisuus.

Edustaa

cDNA: cDNA edustaa transkriptomia.

Genominen DNA: DNA edustaa genomia.

Syntetisoitu/uutettu

cDNA: cDNA syntetisoidaan erityyppisten RNA: iden käänteistranskriptiosta.

Genominen DNA: Genominen DNA voidaan erottaa olemassa olevista genomeista.

Sisältö

cDNA: cDNA koostuu eksoneista tai koodaavista alueista.

Genominen DNA: Genominen DNA koostuu organismin koodaavista ja ei-koodaavista sekvensseistä.

Määrä

cDNA: cDNA sisältää muutaman emäsparin.

Genominen DNA: Genominen DNA sisältää suuren määrän emäspareja.

Käyttää

cDNA: cDNA: ta käytetään cDNA -kirjastojen tuottamiseen.

Genominen DNA: Genomista DNA: ta voidaan käyttää genomikirjastojen tuottamiseen.

Johtopäätös

cDNA ja genominen DNA ovat kahdenlaisia ​​DNA -molekyylejä, joita käytetään erityyppisissä molekyylibiologian kokeissa. cDNA syntetisoidaan RNA: sta, ja se koostuu vain eksoneista. Siksi se edustaa organismin transkriptiota. Genominen DNA voidaan helposti erottaa solun ytimestä. Se koostuu sekä koodaavista että ei-koodaavista alueista. Se edustaa tietyn organismin genomia. Suurin ero cDNA: n ja genomisen DNA: n välillä on kussakin DNA -molekyylityypissä läsnä olevan DNA: n tyyppi.

Viite:

1. "CDNA (täydentävä DNA)." Ihmisen geenit, saatavana täältä 2. "GDNA - Genominen DNA | Advanced Analytical (AATI). ” Advanced Analytical Technologies, Inc. (AATI), saatavana täältä. "Genomisen DNA: n eristäminen ja sovellukset." Scribd, saatavana täältä.

Kuva:

1. ”Käänteistranskription polymeraasiketjureaktio” Jpark623-Oma työ (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedia2: n kautta. "Ihmisen genomi geeneihin" (CC BY 2.0) Commons Wikimedian kautta