Tärkein ero - Genomiikka vs Proteomiikka

Genomiikka, proteomiikka ja metabolomiikka ovat kenttiä, jotka liittyvät tutkimukseen ja elävien olentojen luokitteluun niiden genomien, geneettisten ohjeiden perusteella syntetisoitujen proteiinituotteiden ja niiden aineenvaihduntatyyppien perusteella. Genomiikka ja proteomiikka liittyvät läheisesti toisiinsa. The tärkein ero genomiikan ja proteomiikan välillä on se genomiikka on koko geeniryhmän tutkimus solun genomissa, kun taas proteomiikka on koko solun tuottaman proteiinisarjan tutkimus. Metabolomiikka puolestaan ​​on tutkimus koko pienimolekyylipainoisten yhdisteiden joukosta, jotka toimivat solun entsymaattisten reaktioiden substraateina ja sivutuotteina.

Keskeiset alueet

1. Mikä on genomiikka - Määritelmä, tekniikat, luokittelu 2. Mikä on proteomiikka - Määritelmä, tekniikat, luokittelu 3. Mitkä ovat samankaltaisuudet genomiikan ja proteomiikan välillä - Yleiskatsaus 4. Mikä on ero genomiikan ja proteomiikan välillä - Keskeisten erojen vertailu

Keskeiset termit: Geenit, Genomics, Human Genome Project (HGP), Human Proteome Project (HPP), Proteins, Proteome, Proteomics

Mikä on Genomiikka

Genomiikka viittaa genomin koko geenisarjan tutkimukseen. Genomi on organismin täydellinen geneettinen tieto, joka koostuu pääasiassa DNA: sta. Genomiikassa käytetään korkean suorituskyvyn tekniikoita genomien kartoittamiseen, sekvensointiin ja analysointiin. Genomiikkaan liittyviä tekniikoita ovat geenisekvensointistrategiat, kuten suunnattu geenisekvensointi, koko genomin haulikon sekvensointi, ekspressoitujen sekvenssitunnisteiden (EST) rakentaminen, yksittäisten nukleotidipolymorfismien (SNP) tunnistaminen sekä sekvensoidun datan analysointi ja tulkinta eri ohjelmistoja ja tietokantoja. Haulikon sekvensoinnin tärkeimmät vaiheet on esitetty kuvassa 1.

Kuva 1: Ympäristöhaulikkojen sekvensointi (ESS)Näytteenotto, (B) suodatuspartikkelit, (C) DNA: n uuttaminen ja hajotus, (D) kloonaus ja kirjasto, (D) sekvensointi, (E) sekvenssikokoonpano

Genomiikan kaksi pääaluetta ovat rakenteellinen genomiikka ja toiminnallinen genomiikka. Sisään rakenteellinen genomiikka, geenien rakennetta ja suhteellisia sijainteja tutkitaan toiminnallinen genomiikka, tutkitaan geenien toimintaa tai roolia metabolisen toiminnan säätelyssä. Genomin sekvensointiprojektit ovat viimeisin kehitys genomiikassa. Human Genome Project (HGP) valmistui vuonna 2003. Human Genome Projectin tavoitteet olivat:

Ihmisen genomin lisäksi myös hiiren ja riisin genomit on testattu.

Mikä on proteomiikka

Proteomiikka viittaa koko solun tuottaman proteiinisarjan tutkimukseen. Proteomi on täydellinen solun tuottama proteiinisarja. Proteomiikassa 3D -rakenteen ja proteiinien toiminnan karakterisointi suoritetaan suuritehoisilla menetelmillä. Proteomiikkaan liittyvät tekniikat sisältävät proteiinien uuttamisen ja elektroforeettisen erottamisen, proteiinien pilkkomisen käyttämällä trypsiiniä pieniksi paloiksi, aminohapposekvenssin määrittämisen massaspektrometrialla ja proteiinien tunnistamisen käyttämällä proteiinitietokantojen tietoja. Lisäksi proteiinin 3D-rakenne voidaan ennustaa ohjelmistopohjaisilla menetelmillä. Proteiinien ilmentymistä voidaan tutkia proteiinimikrosarjoilla. Proteiini-verkkokarttoja voidaan kehittää proteiini-proteiini-vuorovaikutusten määrittämiseksi. Erilaiset proteomiikan ilmiöt on esitetty kuvassa 2.

Kuva 2: Proteomiikka

Ihmisen genomin geenien proteiinituotteita tutkitaan ihmisen proteomiprojektin (HPP) aikana. Yksi Human Proteome -projektin päätavoitteista on tunnistaa tärkeimpiin sairauksiin liittyvät proteiinit.

Genomiikan ja proteomiikan samankaltaisuudet

Ero genomiikan ja proteomiikan välillä

Määritelmä

Genomiikka: Genomiikka viittaa genomin koko geenisarjan tutkimukseen.

Proteomiikka: Proteomiikka viittaa koko solun tuottaman proteiinisarjan tutkimukseen.

Ilmiöitä

Genomiikka: Genomiikkaan kuuluu genomien kartoitus, sekvensointi ja analysointi.

Proteomiikka: Proteomiikkaan kuuluu proteiinien 3D-rakenne ja toiminta sekä proteiini-proteiini-vuorovaikutus.

Luokitus

Genomiikka: Kaksi genomiikan tyyppiä ovat rakenteellinen genomiikka ja toiminnallinen genomiikka.

Proteomiikka: Kolme proteomiikan tyyppiä ovat rakenteellinen, toiminnallinen ja ekspressioprotomiikka.

Tärkeitä alueita

Genomiikka: Genomin sekvensointihankkeet, kuten Human Genome Project, ovat tärkeitä genomiikan alueita.

Proteomiikka: Proteomitietokannan kehittäminen, kuten SWISS-2DPAGE, ja ohjelmistokehitys tietokoneavusteiseen lääkesuunnitteluun ovat tärkeitä proteomiikan alueita.

Johtopäätös

Genomiikka ja proteomiikka ovat kaksi tieteellistä aluetta, joita käytetään organismien tutkimuksessa. Genomiikka on koko organismin geenisarjan tutkimus, kun taas proteomiikka on tutkimus koko solun tuottamasta proteiinista. Suurin ero genomiikan ja proteomiikan välillä on kunkin kentän kriteerit eliöiden tutkimuksen aikana.

Viite:

1. Griffiths, Anthony JF. "Genomiikka: yleiskatsaus." Johdatus geneettiseen analyysiin. 7. painos., US National Library of Medicine, 1. tammikuuta 1970, saatavana täältä. Rajaton. "Genomiikka ja proteomiikka." Genomiikka ja proteomiikka | Rajaton biologia, saatavana täältä 3. Graves, Paul R. ja Timothy A. J. Haystead. "Molekyylibiologin opas proteomiikkaan." Microbiology and Molecular Biology Reviews, American Society for Microbiology, maaliskuu 2002, saatavana täältä.

Kuva:

1. ”Ympäristöhaulikkojen sekvensointi” John C. Wooley, Adam Godzik, Iddo Friedberg - (CC BY 2.5) Commons Wikimedia2: n kautta. “Proteomiikka”, kirjoittanut Xxl7441, englanninkielisissä Wikibooksissa - Siirretty en.wikibooksista Commonsiin. (Julkinen alue) Commons Wikimedian kautta